Für die Therapie werden vor allem Blätter, Blüten, Wurzeln, Zweige und Rinden verwendet. Ein TCM-Praktiker kann aus ca. 350 Pflanzenteilen wählen. Die Anwendung dieser Arzneistoffe ist eingebettet in ein ganzheitliches theoretisches Konstrukt, das jedes Mittel den Funktionskreisen und Krankheitsfaktoren genau zuordnet. Die Eigenschaften der Arzneimittel sind in der Literatur der chinesischen Medizin differenziert und detailliert beschrieben. Mit diesem Wissen und einer gründlichen Untersuchung kann ein TCM-Arzt ein individuelles Rezept erstellen. Selbst wenn zwei Patienten die gleiche Krankheit haben, werden sich ihre Rezepte wahrscheinlich unterscheiden, da die Chinesische Medizin die Konstitution und die Psyche jedes Einzelnen berücksichtigt. Wenn die Symptome über einen längeren Zeitraum behandelt werden, kann die Zusammensetzung und Intensität der chinesischen Naturheilmittel nach Bedarf angepasst werden. So kann beispielsweise nach längerem Gebrauch eine niedrigere Dosis eines bestimmten Wirkstoffs erforderlich sein.